Arquitectura

Arquitectónicamente es un edificio de planta basilical de piedra de sillería, sencillo y de reducidas dimensiones, de planta cuadrangular, con tres naves, pilastras toscanas, capillas laterales y diversos tipos de bóvedas.

Piezas de interés

Nave principal y cabecera del templo.

Alberga en su interior valiosas piezas ornamentales y tallas de gran valor artístico y devocional, entre las que cabe citar:

• Retablo Mayor, de estilo churrigueresco, realizado entre 1722 y 1738 en el que están representados san Marcelo, su mujer santa Nonia con una niña, y sus doce hijos santos, seis en cada lateral; siendo algunas de las figuras obra del escultor leonés Santiago Velasco.
• El Cristo de los Balderas, que preside la capilla de su mismo nombre, obra de Gregorio Fernández, policromada por Diego Díaz. Una copia de este crucificado procesiona el Miércoles Santo y el Viernes Santo con la Cofradía de las Siete Palabras de Jesús en la Cruz, de la que es imagen titular.
• Imagen de san Marcelo, representado con armadura medieval, que no romana. Preside el retablo mayor. Obra de Gregorio Fernández, policromada por Diego Díaz.
• Imagen de La Inmaculada, sita en la capilla de los Villafañe, que no se puede atribuir con certeza a Gregorio Fernández.
• Arqueta relicario de plata labrada, obra de Hernando Argüello fechada en 1627 que, a su vez, contiene otra arqueta de madera con engastes de aguamarinas y escudos de castillos y leones realizados también en plata y embellecidos con esmaltes. Este segundo contenedor guarda las reliquias del santo. Esta pieza doble está ubicada bajo el altar mayor de la iglesia.
• Arqueta de plata que contiene las reliquias del monje benedictino y mártir San Ramiro, obra del platero leonés Hernando Argüello.
• Cuatro candelabros del siglo XVI que estuvieron en el concilio de Trento.
• Imagen de Santa Marta, obra de Víctor de los Rios realizada en 1947. Procesiona el día del Corpus y es la imagen titular de la Hermandad de Santa Marta y de la Sagrada Cena.

Piezas notables originales de la iglesia de san Marcelo

Actualmente exhibidas bien en el Museo Arqueológico Nacional de Madrid, bien en el Museo de León:

• Espada Jineta Nazarí que portaba, originalmente, la talla de san Marcelo de Gregorio Fernández. "Donada" en 1868 a José Amador de los Ríos, 7.​
• Retablo de san Marcelo. Data de principios del siglo XIV: es un relieve sobre madera policromada de autor anónimo, de composición triangular. Una de las piezas más notables de la imaginería del gótico temprano español.

Tradiciones

Fue tradición desde la creación del ayuntamiento de León hasta finales del siglo XIX, que el concejo municipal, con el corregidor al frente, recibieran la ceniza y la bendición del rector del templo, los miércoles de ceniza.

Durante las fiestas de San Froilán el alcalde, encabezando a la corporación municipal, hace entrega, ceremonialmente, de dos hachas al párroco de San Marcelo. Así mismo, durante estos días salían de San Marcelo y otras parroquias de la ciudad, hasta la catedral, las cantaderas, conmemorando el fin del, legendario, tributo de las cien doncellas.​